Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TXLNAP40222 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TXLNAP40222 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXLNAP40222 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TXLNAP40222 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXLNAP40222 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXLNAP40222 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TXLNAP40222 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXLNAP40222 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TXLNAP40222 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXLNAP40222 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXLNAP40222 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TXLNAP40222 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXLNAP40222 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TXLNAP40222 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXLNAP40222 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TXLNAP40222 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TXLNAP40222 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TXLNAP40222 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms