Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFRP26992 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFRP26992 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFRP26992 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFRP26992 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFRP26992 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFRP26992 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFRP26992 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTFRP26992 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTFRP26992 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms