Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IVDP26440 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IVDP26440 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IVDP26440 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IVDP26440 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IVDP26440 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IVDP26440 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IVDP26440 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IVDP26440 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IVDP26440 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IVDP26440 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IVDP26440 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IVDP26440 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IVDP26440 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IVDP26440 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IVDP26440 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IVDP26440 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IVDP26440 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IVDP26440 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IVDP26440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IVDP26440 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IVDP26440 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IVDP26440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IVDP26440 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IVDP26440 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IVDP26440 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IVDP26440 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IVDP26440 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IVDP26440 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IVDP26440 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IVDP26440 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IVDP26440 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IVDP26440 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IVDP26440 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IVDP26440 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IVDP26440 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IVDP26440 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IVDP26440 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IVDP26440 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IVDP26440 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IVDP26440 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IVDP26440 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IVDP26440 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IVDP26440 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IVDP26440 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IVDP26440 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IVDP26440 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IVDP26440 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IVDP26440 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IVDP26440 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IVDP26440 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IVDP26440 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IVDP26440 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IVDP26440 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IVDP26440 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IVDP26440 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IVDP26440 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IVDP26440 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IVDP26440 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IVDP26440 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IVDP26440 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IVDP26440 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IVDP26440 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IVDP26440 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IVDP26440 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IVDP26440 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IVDP26440 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IVDP26440 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IVDP26440 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IVDP26440 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IVDP26440 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IVDP26440 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IVDP26440 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IVDP26440 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IVDP26440 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IVDP26440 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IVDP26440 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IVDP26440 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IVDP26440 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IVDP26440 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IVDP26440 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IVDP26440 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IVDP26440 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IVDP26440 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IVDP26440 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IVDP26440 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IVDP26440 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IVDP26440 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IVDP26440 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IVDP26440 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IVDP26440 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IVDP26440 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IVDP26440 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IVDP26440 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IVDP26440 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IVDP26440 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IVDP26440 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IVDP26440 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IVDP26440 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IVDP26440 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms