Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRDP23468 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRDP23468 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRDP23468 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRDP23468 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRDP23468 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRDP23468 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRDP23468 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRDP23468 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRDP23468 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRDP23468 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRDP23468 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRDP23468 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRDP23468 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRDP23468 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRDP23468 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRDP23468 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRDP23468 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRDP23468 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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