Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLRA1P23415 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLRA1P23415 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLRA1P23415 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLRA1P23415 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLRA1P23415 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLRA1P23415 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLRA1P23415 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLRA1P23415 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLRA1P23415 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLRA1P23415 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLRA1P23415 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLRA1P23415 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLRA1P23415 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms