Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFNA1P20827 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNA1P20827 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFNA1P20827 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFNA1P20827 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFNA1P20827 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFNA1P20827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EFNA1P20827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFNA1P20827 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFNA1P20827 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFNA1P20827 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms