Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD53P19397 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD53P19397 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD53P19397 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD53P19397 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD53P19397 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD53P19397 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD53P19397 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD53P19397 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD53P19397 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD53P19397 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD53P19397 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD53P19397 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD53P19397 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD53P19397 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD53P19397 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD53P19397 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD53P19397 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD53P19397 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD53P19397 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD53P19397 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD53P19397 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD53P19397 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD53P19397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD53P19397 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD53P19397 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD53P19397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD53P19397 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD53P19397 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD53P19397 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD53P19397 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD53P19397 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD53P19397 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD53P19397 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD53P19397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD53P19397 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD53P19397 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD53P19397 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD53P19397 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD53P19397 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD53P19397 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD53P19397 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD53P19397 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD53P19397 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD53P19397 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD53P19397 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD53P19397 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD53P19397 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD53P19397 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD53P19397 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD53P19397 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD53P19397 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD53P19397 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD53P19397 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD53P19397 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD53P19397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD53P19397 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD53P19397 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD53P19397 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD53P19397 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD53P19397 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD53P19397 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD53P19397 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD53P19397 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD53P19397 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD53P19397 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD53P19397 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD53P19397 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD53P19397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD53P19397 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD53P19397 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD53P19397 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD53P19397 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD53P19397 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD53P19397 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD53P19397 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CD53P19397 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD53P19397 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD53P19397 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD53P19397 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD53P19397 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD53P19397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD53P19397 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD53P19397 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD53P19397 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD53P19397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD53P19397 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD53P19397 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD53P19397 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD53P19397 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD53P19397 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD53P19397 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD53P19397 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD53P19397 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD53P19397 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD53P19397 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD53P19397 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD53P19397 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD53P19397 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD53P19397 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms