Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOQP17081 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOQP17081 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOQP17081 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOQP17081 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOQP17081 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOQP17081 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOQP17081 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOQP17081 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOQP17081 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOQP17081 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHOQP17081 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOQP17081 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOQP17081 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOQP17081 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOQP17081 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOQP17081 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOQP17081 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOQP17081 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOQP17081 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOQP17081 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOQP17081 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RHOQP17081 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RHOQP17081 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOQP17081 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOQP17081 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOQP17081 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOQP17081 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOQP17081 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOQP17081 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOQP17081 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOQP17081 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOQP17081 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOQP17081 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHOQP17081 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RHOQP17081 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOQP17081 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOQP17081 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOQP17081 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOQP17081 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOQP17081 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOQP17081 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOQP17081 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RHOQP17081 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOQP17081 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOQP17081 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOQP17081 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOQP17081 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RHOQP17081 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOQP17081 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOQP17081 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOQP17081 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOQP17081 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOQP17081 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOQP17081 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOQP17081 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOQP17081 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOQP17081 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOQP17081 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOQP17081 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOQP17081 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOQP17081 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOQP17081 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOQP17081 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOQP17081 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOQP17081 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOQP17081 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOQP17081 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOQP17081 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHOQP17081 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOQP17081 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOQP17081 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOQP17081 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOQP17081 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOQP17081 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOQP17081 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOQP17081 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOQP17081 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOQP17081 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOQP17081 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOQP17081 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOQP17081 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOQP17081 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOQP17081 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOQP17081 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOQP17081 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOQP17081 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOQP17081 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOQP17081 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOQP17081 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOQP17081 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHOQP17081 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHOQP17081 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOQP17081 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOQP17081 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOQP17081 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RHOQP17081 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOQP17081 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOQP17081 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOQP17081 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms