Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG2P13727 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG2P13727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG2P13727 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRG2P13727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG2P13727 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG2P13727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG2P13727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG2P13727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG2P13727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG2P13727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG2P13727 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG2P13727 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG2P13727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRG2P13727 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG2P13727 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG2P13727 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG2P13727 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG2P13727 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG2P13727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG2P13727 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG2P13727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG2P13727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG2P13727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG2P13727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG2P13727 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG2P13727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG2P13727 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG2P13727 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG2P13727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG2P13727 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG2P13727 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG2P13727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG2P13727 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG2P13727 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG2P13727 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG2P13727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG2P13727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG2P13727 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG2P13727 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG2P13727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG2P13727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG2P13727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG2P13727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG2P13727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG2P13727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG2P13727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG2P13727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG2P13727 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG2P13727 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG2P13727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRG2P13727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG2P13727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG2P13727 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG2P13727 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG2P13727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG2P13727 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG2P13727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG2P13727 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG2P13727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG2P13727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG2P13727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG2P13727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG2P13727 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG2P13727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG2P13727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG2P13727 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG2P13727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG2P13727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG2P13727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG2P13727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG2P13727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG2P13727 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG2P13727 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG2P13727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG2P13727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG2P13727 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG2P13727 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG2P13727 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG2P13727 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG2P13727 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG2P13727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG2P13727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG2P13727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG2P13727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG2P13727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG2P13727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG2P13727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG2P13727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG2P13727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG2P13727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG2P13727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG2P13727 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG2P13727 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG2P13727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG2P13727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG2P13727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG2P13727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG2P13727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG2P13727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms