Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEPDP12955 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEPDP12955 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEPDP12955 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEPDP12955 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEPDP12955 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEPDP12955 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEPDP12955 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEPDP12955 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEPDP12955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEPDP12955 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEPDP12955 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEPDP12955 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEPDP12955 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEPDP12955 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEPDP12955 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEPDP12955 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEPDP12955 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEPDP12955 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEPDP12955 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEPDP12955 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEPDP12955 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEPDP12955 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEPDP12955 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEPDP12955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEPDP12955 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEPDP12955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEPDP12955 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEPDP12955 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEPDP12955 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEPDP12955 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEPDP12955 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEPDP12955 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEPDP12955 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEPDP12955 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEPDP12955 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEPDP12955 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEPDP12955 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEPDP12955 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEPDP12955 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEPDP12955 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEPDP12955 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEPDP12955 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEPDP12955 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEPDP12955 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEPDP12955 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PEPDP12955 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEPDP12955 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEPDP12955 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEPDP12955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEPDP12955 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEPDP12955 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEPDP12955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEPDP12955 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEPDP12955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEPDP12955 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEPDP12955 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEPDP12955 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEPDP12955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEPDP12955 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEPDP12955 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEPDP12955 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEPDP12955 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEPDP12955 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEPDP12955 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEPDP12955 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEPDP12955 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEPDP12955 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEPDP12955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEPDP12955 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEPDP12955 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEPDP12955 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PEPDP12955 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEPDP12955 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEPDP12955 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEPDP12955 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEPDP12955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEPDP12955 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEPDP12955 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEPDP12955 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEPDP12955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEPDP12955 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEPDP12955 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEPDP12955 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEPDP12955 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEPDP12955 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEPDP12955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEPDP12955 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEPDP12955 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEPDP12955 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEPDP12955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEPDP12955 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEPDP12955 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEPDP12955 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEPDP12955 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEPDP12955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEPDP12955 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PEPDP12955 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEPDP12955 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEPDP12955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms