Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFD1P11586 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFD1P11586 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFD1P11586 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1P11586 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1P11586 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFD1P11586 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1P11586 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1P11586 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFD1P11586 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFD1P11586 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTHFD1P11586 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1P11586 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1P11586 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1P11586 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms