Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARAP10276 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARAP10276 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARAP10276 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARAP10276 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARAP10276 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARAP10276 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARAP10276 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARAP10276 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARAP10276 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARAP10276 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARAP10276 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARAP10276 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARAP10276 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARAP10276 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARAP10276 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARAP10276 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARAP10276 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARAP10276 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARAP10276 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARAP10276 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARAP10276 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARAP10276 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARAP10276 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARAP10276 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARAP10276 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RARAP10276 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RARAP10276 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RARAP10276 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARAP10276 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARAP10276 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARAP10276 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARAP10276 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RARAP10276 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARAP10276 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARAP10276 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARAP10276 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARAP10276 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARAP10276 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARAP10276 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RARAP10276 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARAP10276 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARAP10276 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARAP10276 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARAP10276 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARAP10276 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARAP10276 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARAP10276 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARAP10276 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RARAP10276 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARAP10276 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARAP10276 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARAP10276 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARAP10276 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARAP10276 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARAP10276 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARAP10276 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARAP10276 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARAP10276 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARAP10276 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARAP10276 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARAP10276 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARAP10276 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARAP10276 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARAP10276 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARAP10276 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARAP10276 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARAP10276 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARAP10276 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RARAP10276 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARAP10276 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARAP10276 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RARAP10276 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RARAP10276 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARAP10276 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARAP10276 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARAP10276 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARAP10276 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARAP10276 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARAP10276 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARAP10276 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARAP10276 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARAP10276 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARAP10276 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARAP10276 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARAP10276 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARAP10276 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARAP10276 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARAP10276 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARAP10276 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARAP10276 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARAP10276 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARAP10276 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARAP10276 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARAP10276 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms