Protein–RNA interactions for Protein: P0C842

LINC00614, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00614, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00614P0C842 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00614P0C842 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00614P0C842 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00614P0C842 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00614P0C842 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00614P0C842 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00614P0C842 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00614P0C842 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00614P0C842 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00614P0C842 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms