Protein–RNA interactions for Protein: P08621

SNRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70P08621 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP70P08621 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP70P08621 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP70P08621 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP70P08621 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP70P08621 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP70P08621 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP70P08621 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP70P08621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms