Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC1P02654 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC1P02654 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC1P02654 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC1P02654 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC1P02654 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC1P02654 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC1P02654 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC1P02654 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC1P02654 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC1P02654 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC1P02654 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC1P02654 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC1P02654 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC1P02654 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC1P02654 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC1P02654 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC1P02654 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC1P02654 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC1P02654 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC1P02654 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC1P02654 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC1P02654 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC1P02654 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC1P02654 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC1P02654 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC1P02654 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC1P02654 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC1P02654 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC1P02654 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC1P02654 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC1P02654 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC1P02654 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC1P02654 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC1P02654 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC1P02654 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC1P02654 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC1P02654 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC1P02654 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC1P02654 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC1P02654 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC1P02654 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC1P02654 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC1P02654 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC1P02654 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC1P02654 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC1P02654 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC1P02654 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC1P02654 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC1P02654 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC1P02654 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC1P02654 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC1P02654 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC1P02654 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC1P02654 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC1P02654 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC1P02654 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC1P02654 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC1P02654 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC1P02654 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC1P02654 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC1P02654 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC1P02654 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC1P02654 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOC1P02654 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC1P02654 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC1P02654 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC1P02654 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC1P02654 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC1P02654 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC1P02654 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC1P02654 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC1P02654 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC1P02654 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC1P02654 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC1P02654 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC1P02654 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC1P02654 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC1P02654 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC1P02654 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC1P02654 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC1P02654 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOC1P02654 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC1P02654 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC1P02654 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC1P02654 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC1P02654 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC1P02654 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC1P02654 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC1P02654 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms