Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOC1P02654 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOC1P02654 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOC1P02654 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
APOC1P02654 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOC1P02654 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOC1P02654 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOC1P02654 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOC1P02654 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOC1P02654 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOC1P02654 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOC1P02654 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOC1P02654 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOC1P02654 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOC1P02654 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOC1P02654 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOC1P02654 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOC1P02654 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC1P02654 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC1P02654 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOC1P02654 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOC1P02654 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC1P02654 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOC1P02654 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOC1P02654 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOC1P02654 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOC1P02654 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC1P02654 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOC1P02654 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOC1P02654 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC1P02654 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC1P02654 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC1P02654 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOC1P02654 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOC1P02654 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOC1P02654 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOC1P02654 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC1P02654 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC1P02654 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC1P02654 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOC1P02654 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOC1P02654 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOC1P02654 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC1P02654 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOC1P02654 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOC1P02654 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOC1P02654 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOC1P02654 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOC1P02654 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOC1P02654 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOC1P02654 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOC1P02654 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOC1P02654 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOC1P02654 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOC1P02654 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC1P02654 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC1P02654 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOC1P02654 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOC1P02654 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC1P02654 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC1P02654 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC1P02654 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC1P02654 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOC1P02654 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC1P02654 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOC1P02654 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC1P02654 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOC1P02654 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC1P02654 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC1P02654 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOC1P02654 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOC1P02654 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOC1P02654 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC1P02654 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC1P02654 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC1P02654 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOC1P02654 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOC1P02654 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC1P02654 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC1P02654 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC1P02654 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC1P02654 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOC1P02654 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC1P02654 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC1P02654 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC1P02654 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOC1P02654 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC1P02654 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC1P02654 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC1P02654 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC1P02654 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC1P02654 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC1P02654 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC1P02654 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC1P02654 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC1P02654 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC1P02654 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC1P02654 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC1P02654 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC1P02654 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1326.2 ms