Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMNAP02545 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMNAP02545 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNAP02545 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNAP02545 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNAP02545 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNAP02545 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNAP02545 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNAP02545 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNAP02545 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMNAP02545 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMNAP02545 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNAP02545 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNAP02545 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNAP02545 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNAP02545 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNAP02545 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNAP02545 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNAP02545 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNAP02545 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNAP02545 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMNAP02545 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNAP02545 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMNAP02545 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMNAP02545 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMNAP02545 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNAP02545 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNAP02545 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMNAP02545 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMNAP02545 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNAP02545 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNAP02545 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMNAP02545 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNAP02545 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNAP02545 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNAP02545 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNAP02545 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNAP02545 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMNAP02545 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNAP02545 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNAP02545 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNAP02545 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNAP02545 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMNAP02545 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNAP02545 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMNAP02545 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNAP02545 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMNAP02545 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNAP02545 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNAP02545 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNAP02545 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNAP02545 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNAP02545 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNAP02545 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNAP02545 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNAP02545 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNAP02545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNAP02545 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNAP02545 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMNAP02545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNAP02545 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNAP02545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNAP02545 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNAP02545 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNAP02545 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNAP02545 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNAP02545 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNAP02545 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNAP02545 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNAP02545 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNAP02545 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNAP02545 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNAP02545 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNAP02545 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNAP02545 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNAP02545 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNAP02545 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNAP02545 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNAP02545 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNAP02545 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNAP02545 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNAP02545 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNAP02545 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNAP02545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNAP02545 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNAP02545 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNAP02545 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNAP02545 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNAP02545 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNAP02545 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNAP02545 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNAP02545 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNAP02545 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNAP02545 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNAP02545 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms