Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBE1P02100 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBE1P02100 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBE1P02100 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBE1P02100 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBE1P02100 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBE1P02100 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HBE1P02100 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBE1P02100 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBE1P02100 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBE1P02100 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBE1P02100 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBE1P02100 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBE1P02100 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBE1P02100 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBE1P02100 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBE1P02100 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBE1P02100 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HBE1P02100 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HBE1P02100 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HBE1P02100 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBE1P02100 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBE1P02100 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBE1P02100 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBE1P02100 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBE1P02100 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBE1P02100 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBE1P02100 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBE1P02100 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBE1P02100 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBE1P02100 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBE1P02100 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBE1P02100 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HBE1P02100 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBE1P02100 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBE1P02100 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBE1P02100 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBE1P02100 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBE1P02100 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBE1P02100 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBE1P02100 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBE1P02100 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBE1P02100 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBE1P02100 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBE1P02100 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBE1P02100 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBE1P02100 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBE1P02100 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBE1P02100 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBE1P02100 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HBE1P02100 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HBE1P02100 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HBE1P02100 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HBE1P02100 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HBE1P02100 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HBE1P02100 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HBE1P02100 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HBE1P02100 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HBE1P02100 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HBE1P02100 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HBE1P02100 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HBE1P02100 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HBE1P02100 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HBE1P02100 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HBE1P02100 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HBE1P02100 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HBE1P02100 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HBE1P02100 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HBE1P02100 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HBE1P02100 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HBE1P02100 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HBE1P02100 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HBE1P02100 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HBE1P02100 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HBE1P02100 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HBE1P02100 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HBE1P02100 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HBE1P02100 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HBE1P02100 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HBE1P02100 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HBE1P02100 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HBE1P02100 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HBE1P02100 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HBE1P02100 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HBE1P02100 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HBE1P02100 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HBE1P02100 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HBE1P02100 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HBE1P02100 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HBE1P02100 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HBE1P02100 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HBE1P02100 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HBE1P02100 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBE1P02100 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBE1P02100 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBE1P02100 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBE1P02100 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBE1P02100 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBE1P02100 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HBE1P02100 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms