Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-AP01891 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-AP01891 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-AP01891 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-AP01891 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-AP01891 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-AP01891 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-AP01891 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-AP01891 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms