Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK3AO75631 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3AO75631 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3AO75631 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3AO75631 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3AO75631 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3AO75631 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3AO75631 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3AO75631 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3AO75631 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3AO75631 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3AO75631 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3AO75631 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPK3AO75631 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK3AO75631 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3AO75631 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK3AO75631 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK3AO75631 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3AO75631 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms