Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1O75570 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRF1O75570 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1O75570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1O75570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTRF1O75570 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTRF1O75570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTRF1O75570 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTRF1O75570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms