Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM17BO60830 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM17BO60830 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM17BO60830 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIMM17BO60830 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM17BO60830 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM17BO60830 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM17BO60830 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIMM17BO60830 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms