Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSPAN3O60637 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN3O60637 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN3O60637 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSPAN3O60637 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSPAN3O60637 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSPAN3O60637 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TSPAN3O60637 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSPAN3O60637 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSPAN3O60637 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN3O60637 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSPAN3O60637 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSPAN3O60637 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSPAN3O60637 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSPAN3O60637 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSPAN3O60637 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSPAN3O60637 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSPAN3O60637 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms