Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF13O43567 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF13O43567 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF13O43567 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF13O43567 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF13O43567 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF13O43567 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF13O43567 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF13O43567 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF13O43567 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF13O43567 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF13O43567 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF13O43567 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF13O43567 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF13O43567 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF13O43567 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF13O43567 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF13O43567 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF13O43567 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF13O43567 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF13O43567 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF13O43567 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF13O43567 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF13O43567 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF13O43567 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF13O43567 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF13O43567 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF13O43567 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF13O43567 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF13O43567 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF13O43567 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF13O43567 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF13O43567 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF13O43567 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF13O43567 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF13O43567 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF13O43567 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF13O43567 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF13O43567 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF13O43567 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF13O43567 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF13O43567 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF13O43567 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF13O43567 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF13O43567 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF13O43567 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF13O43567 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF13O43567 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF13O43567 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF13O43567 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF13O43567 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF13O43567 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF13O43567 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF13O43567 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF13O43567 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF13O43567 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF13O43567 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF13O43567 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF13O43567 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF13O43567 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF13O43567 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF13O43567 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF13O43567 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF13O43567 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF13O43567 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF13O43567 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF13O43567 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF13O43567 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF13O43567 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF13O43567 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF13O43567 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF13O43567 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF13O43567 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF13O43567 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF13O43567 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF13O43567 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF13O43567 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF13O43567 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF13O43567 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF13O43567 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF13O43567 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF13O43567 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF13O43567 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF13O43567 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF13O43567 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF13O43567 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF13O43567 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF13O43567 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF13O43567 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF13O43567 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF13O43567 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF13O43567 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF13O43567 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF13O43567 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF13O43567 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF13O43567 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF13O43567 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF13O43567 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF13O43567 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF13O43567 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms