Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOXO15266 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOXO15266 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOXO15266 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOXO15266 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOXO15266 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOXO15266 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOXO15266 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOXO15266 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOXO15266 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOXO15266 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOXO15266 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOXO15266 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOXO15266 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOXO15266 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOXO15266 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOXO15266 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOXO15266 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOXO15266 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHOXO15266 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOXO15266 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOXO15266 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOXO15266 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOXO15266 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOXO15266 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOXO15266 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOXO15266 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOXO15266 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOXO15266 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOXO15266 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOXO15266 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOXO15266 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOXO15266 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOXO15266 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOXO15266 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOXO15266 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOXO15266 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOXO15266 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOXO15266 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOXO15266 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOXO15266 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHOXO15266 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOXO15266 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOXO15266 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHOXO15266 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHOXO15266 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOXO15266 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOXO15266 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHOXO15266 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHOXO15266 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOXO15266 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHOXO15266 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOXO15266 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOXO15266 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOXO15266 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHOXO15266 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHOXO15266 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHOXO15266 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOXO15266 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOXO15266 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOXO15266 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOXO15266 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOXO15266 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOXO15266 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOXO15266 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOXO15266 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOXO15266 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOXO15266 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOXO15266 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOXO15266 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOXO15266 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOXO15266 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOXO15266 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOXO15266 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOXO15266 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOXO15266 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHOXO15266 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOXO15266 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHOXO15266 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHOXO15266 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHOXO15266 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHOXO15266 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOXO15266 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOXO15266 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOXO15266 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOXO15266 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOXO15266 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOXO15266 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOXO15266 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOXO15266 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOXO15266 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOXO15266 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOXO15266 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOXO15266 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOXO15266 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOXO15266 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOXO15266 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOXO15266 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOXO15266 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOXO15266 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms