Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VILLO15195 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VILLO15195 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VILLO15195 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VILLO15195 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VILLO15195 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VILLO15195 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VILLO15195 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VILLO15195 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VILLO15195 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VILLO15195 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VILLO15195 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VILLO15195 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VILLO15195 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VILLO15195 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VILLO15195 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VILLO15195 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VILLO15195 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VILLO15195 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VILLO15195 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VILLO15195 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VILLO15195 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VILLO15195 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VILLO15195 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VILLO15195 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VILLO15195 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VILLO15195 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VILLO15195 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VILLO15195 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VILLO15195 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VILLO15195 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VILLO15195 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VILLO15195 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VILLO15195 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VILLO15195 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VILLO15195 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VILLO15195 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VILLO15195 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VILLO15195 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VILLO15195 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VILLO15195 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VILLO15195 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VILLO15195 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VILLO15195 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VILLO15195 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VILLO15195 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VILLO15195 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VILLO15195 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VILLO15195 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
VILLO15195 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VILLO15195 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VILLO15195 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VILLO15195 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VILLO15195 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VILLO15195 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VILLO15195 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VILLO15195 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VILLO15195 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VILLO15195 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VILLO15195 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VILLO15195 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VILLO15195 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VILLO15195 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VILLO15195 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VILLO15195 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VILLO15195 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VILLO15195 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VILLO15195 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VILLO15195 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VILLO15195 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VILLO15195 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VILLO15195 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VILLO15195 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VILLO15195 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VILLO15195 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VILLO15195 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VILLO15195 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VILLO15195 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VILLO15195 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VILLO15195 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VILLO15195 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VILLO15195 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms