Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM24O15164 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM24O15164 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM24O15164 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM24O15164 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM24O15164 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM24O15164 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM24O15164 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM24O15164 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM24O15164 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM24O15164 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM24O15164 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM24O15164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM24O15164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM24O15164 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM24O15164 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM24O15164 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM24O15164 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM24O15164 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM24O15164 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM24O15164 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM24O15164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms