Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNPHO15079 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNPHO15079 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNPHO15079 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNPHO15079 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNPHO15079 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNPHO15079 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNPHO15079 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNPHO15079 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNPHO15079 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNPHO15079 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNPHO15079 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNPHO15079 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNPHO15079 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNPHO15079 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNPHO15079 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNPHO15079 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNPHO15079 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNPHO15079 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNPHO15079 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNPHO15079 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNPHO15079 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNPHO15079 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNPHO15079 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNPHO15079 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNPHO15079 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNPHO15079 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNPHO15079 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNPHO15079 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNPHO15079 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNPHO15079 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNPHO15079 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNPHO15079 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNPHO15079 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNPHO15079 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNPHO15079 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNPHO15079 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNPHO15079 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNPHO15079 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNPHO15079 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNPHO15079 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNPHO15079 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNPHO15079 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNPHO15079 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNPHO15079 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNPHO15079 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNPHO15079 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNPHO15079 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNPHO15079 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNPHO15079 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNPHO15079 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNPHO15079 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNPHO15079 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNPHO15079 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNPHO15079 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNPHO15079 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNPHO15079 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNPHO15079 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNPHO15079 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNPHO15079 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNPHO15079 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNPHO15079 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNPHO15079 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNPHO15079 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNPHO15079 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNPHO15079 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNPHO15079 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNPHO15079 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNPHO15079 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNPHO15079 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNPHO15079 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNPHO15079 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNPHO15079 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNPHO15079 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNPHO15079 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNPHO15079 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNPHO15079 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNPHO15079 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNPHO15079 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNPHO15079 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNPHO15079 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNPHO15079 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNPHO15079 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNPHO15079 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNPHO15079 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNPHO15079 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNPHO15079 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNPHO15079 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNPHO15079 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNPHO15079 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNPHO15079 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNPHO15079 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNPHO15079 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNPHO15079 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNPHO15079 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms