Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAMP3O14828 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAMP3O14828 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAMP3O14828 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAMP3O14828 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAMP3O14828 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAMP3O14828 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAMP3O14828 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAMP3O14828 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAMP3O14828 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAMP3O14828 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAMP3O14828 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAMP3O14828 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAMP3O14828 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAMP3O14828 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAMP3O14828 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAMP3O14828 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAMP3O14828 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAMP3O14828 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms