Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PODXLO00592 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXLO00592 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXLO00592 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXLO00592 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PODXLO00592 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PODXLO00592 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXLO00592 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXLO00592 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXLO00592 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXLO00592 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PODXLO00592 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXLO00592 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXLO00592 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PODXLO00592 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PODXLO00592 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXLO00592 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXLO00592 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PODXLO00592 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXLO00592 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PODXLO00592 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PODXLO00592 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PODXLO00592 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXLO00592 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXLO00592 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PODXLO00592 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PODXLO00592 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXLO00592 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PODXLO00592 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PODXLO00592 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PODXLO00592 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXLO00592 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXLO00592 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PODXLO00592 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXLO00592 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXLO00592 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PODXLO00592 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PODXLO00592 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXLO00592 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXLO00592 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PODXLO00592 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXLO00592 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXLO00592 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PODXLO00592 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PODXLO00592 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PODXLO00592 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PODXLO00592 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PODXLO00592 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXLO00592 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PODXLO00592 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXLO00592 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PODXLO00592 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXLO00592 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PODXLO00592 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXLO00592 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXLO00592 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PODXLO00592 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PODXLO00592 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PODXLO00592 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PODXLO00592 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PODXLO00592 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PODXLO00592 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PODXLO00592 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PODXLO00592 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PODXLO00592 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PODXLO00592 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PODXLO00592 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PODXLO00592 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PODXLO00592 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PODXLO00592 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PODXLO00592 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PODXLO00592 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PODXLO00592 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PODXLO00592 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PODXLO00592 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PODXLO00592 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PODXLO00592 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PODXLO00592 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PODXLO00592 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PODXLO00592 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PODXLO00592 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PODXLO00592 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PODXLO00592 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PODXLO00592 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PODXLO00592 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PODXLO00592 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PODXLO00592 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PODXLO00592 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PODXLO00592 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PODXLO00592 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXLO00592 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PODXLO00592 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXLO00592 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXLO00592 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PODXLO00592 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PODXLO00592 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PODXLO00592 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PODXLO00592 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PODXLO00592 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PODXLO00592 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms