Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8VRH5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8VRH5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8VRH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8VRH5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8VRH5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
F8VRH5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
F8VRH5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8VRH5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8VRH5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8VRH5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8VRH5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8VRH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8VRH5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8VRH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8VRH5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8VRH5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8VRH5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8VRH5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8VRH5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8VRH5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8VRH5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8VRH5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
F8VRH5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
F8VRH5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
F8VRH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
F8VRH5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
F8VRH5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
F8VRH5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F8VRH5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
F8VRH5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
F8VRH5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F8VRH5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F8VRH5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
F8VRH5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
F8VRH5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
F8VRH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
F8VRH5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
F8VRH5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
F8VRH5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
F8VRH5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
F8VRH5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
F8VRH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
F8VRH5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
F8VRH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
F8VRH5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
F8VRH5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
F8VRH5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F8VRH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F8VRH5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
F8VRH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
F8VRH5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
F8VRH5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
F8VRH5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F8VRH5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
F8VRH5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
F8VRH5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
F8VRH5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
F8VRH5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8VRH5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8VRH5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8VRH5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8VRH5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8VRH5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8VRH5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8VRH5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8VRH5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8VRH5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F8VRH5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8VRH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8VRH5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8VRH5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F8VRH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F8VRH5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
F8VRH5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8VRH5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8VRH5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F8VRH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F8VRH5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8VRH5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F8VRH5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8VRH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8VRH5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
F8VRH5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8VRH5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8VRH5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VRH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VRH5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VRH5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VRH5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VRH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VRH5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VRH5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VRH5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VRH5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms