Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL3

RNF212B, RING finger protein 212B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212BA8MTL3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF212BA8MTL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF212BA8MTL3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF212BA8MTL3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF212BA8MTL3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF212BA8MTL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF212BA8MTL3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF212BA8MTL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms