Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC01549A6NIU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC01549A6NIU2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC01549A6NIU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01549A6NIU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01549A6NIU2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC01549A6NIU2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01549A6NIU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01549A6NIU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01549A6NIU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01549A6NIU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01549A6NIU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01549A6NIU2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms