Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBY3A6NI87 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBY3A6NI87 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBY3A6NI87 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBY3A6NI87 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBY3A6NI87 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBY3A6NI87 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms