Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM64A6NGJ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM64A6NGJ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM64A6NGJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM64A6NGJ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM64A6NGJ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM64A6NGJ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM64A6NGJ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM64A6NGJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64A6NGJ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM64A6NGJ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM64A6NGJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM64A6NGJ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM64A6NGJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms