Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNDIG1LA6NDD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNDIG1LA6NDD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNDIG1LA6NDD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1LA6NDD5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNDIG1LA6NDD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNDIG1LA6NDD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNDIG1LA6NDD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1LA6NDD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNDIG1LA6NDD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms