Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT87PA6NCN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT87PA6NCN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT87PA6NCN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT87PA6NCN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT87PA6NCN2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT87PA6NCN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT87PA6NCN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT87PA6NCN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT87PA6NCN2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT87PA6NCN2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms