Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
A0A1W2PQJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
A0A1W2PQJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
A0A1W2PQJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
A0A1W2PQJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
A0A1W2PQJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
A0A1W2PQJ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
A0A1W2PQJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
A0A1W2PQJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A1W2PQJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
A0A1W2PQJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A1W2PQJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A1W2PQJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A1W2PQJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A1W2PQJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A1W2PQJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A1W2PQJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A1W2PQJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms