Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A1W2PPL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1W2PPL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1W2PPL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PPL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PPL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPL8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPL8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms