Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPK0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPK0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPK0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PPK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PPK0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PPK0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPK0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PPK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms