Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0J9YXV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0J9YXV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0J9YXV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A0A0J9YXV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0J9YXV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A0A0J9YXV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A0A0J9YXV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0J9YXV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0J9YXV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0J9YXV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms