Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-16A0A0C4DH30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-16A0A0C4DH30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGHV3-16A0A0C4DH30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IGHV3-16A0A0C4DH30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms