Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHV3-16A0A0C4DH30 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-16A0A0C4DH30 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-16A0A0C4DH30 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-16A0A0C4DH30 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-16A0A0C4DH30 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-16A0A0C4DH30 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-16A0A0C4DH30 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-16A0A0C4DH30 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-16A0A0C4DH30 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-16A0A0C4DH30 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-16A0A0C4DH30 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-16A0A0C4DH30 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-16A0A0C4DH30 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-16A0A0C4DH30 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-16A0A0C4DH30 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-16A0A0C4DH30 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHV3-16A0A0C4DH30 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-16A0A0C4DH30 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-16A0A0C4DH30 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-16A0A0C4DH30 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-16A0A0C4DH30 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-16A0A0C4DH30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-16A0A0C4DH30 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHV3-16A0A0C4DH30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHV3-16A0A0C4DH30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms