Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGKV1-27A0A075B6S5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV1-27A0A075B6S5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1-27A0A075B6S5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1-27A0A075B6S5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1-27A0A075B6S5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1-27A0A075B6S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV1-27A0A075B6S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-27A0A075B6S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms