Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFRSF18Q9Y5U5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF18Q9Y5U5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 538.4 ms