RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.54■■■■□ 3.44
NISCH-201ENST00000345716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.44■■■■□ 3.42
NISCH-201ENST00000345716 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
NISCH-201ENST00000345716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.58■■■■□ 3.13
NISCH-201ENST00000345716 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.37■■■□□ 2.93
NISCH-201ENST00000345716 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
NISCH-201ENST00000345716 APLP2Q06481 763 aa32.53■■■□□ 2.8
NISCH-201ENST00000345716 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.43■■■□□ 2.78
NISCH-201ENST00000345716 TRIM41Q8WV44 630 aa32.36■■■□□ 2.77
NISCH-201ENST00000345716 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
NISCH-201ENST00000345716 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
NISCH-201ENST00000345716 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
NISCH-201ENST00000345716 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
NISCH-201ENST00000345716 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
NISCH-201ENST00000345716 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
NISCH-201ENST00000345716 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
NISCH-201ENST00000345716 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.49■■■□□ 2.63
NISCH-201ENST00000345716 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
NISCH-201ENST00000345716 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.28■■■□□ 2.6
NISCH-201ENST00000345716 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
NISCH-201ENST00000345716 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
NISCH-201ENST00000345716 ABCC9O60706 1549 aa31.05■■■□□ 2.56
NISCH-201ENST00000345716 HRCP23327 699 aa30.94■■■□□ 2.54
NISCH-201ENST00000345716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.511e-10■■■■□ 21.1
NISCH-201ENST00000345716 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
NISCH-201ENST00000345716 ITGAEP38570 1179 aa30.64■■■□□ 2.5
NISCH-201ENST00000345716 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
NISCH-201ENST00000345716 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
NISCH-201ENST00000345716 NEFLP07196 543 aa30.36■■■□□ 2.45
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
NISCH-201ENST00000345716 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.25■■■□□ 2.43
NISCH-201ENST00000345716 SCRIBQ14160 1630 aa30.03■■■□□ 2.4
NISCH-201ENST00000345716 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.01■■■□□ 2.39
NISCH-201ENST00000345716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30■■■□□ 2.39
NISCH-201ENST00000345716 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.98■■■□□ 2.39
NISCH-201ENST00000345716 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
NISCH-201ENST00000345716 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
NISCH-201ENST00000345716 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.88■■■□□ 2.37
NISCH-201ENST00000345716 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
NISCH-201ENST00000345716 TRIM52Q96A61 297 aa29.66■■■□□ 2.34
NISCH-201ENST00000345716 NEUROD1Q13562 356 aa29.64■■■□□ 2.34
NISCH-201ENST00000345716 P3H3Q8IVL6 736 aa29.53■■■□□ 2.32
NISCH-201ENST00000345716 FBLN2P98095 1184 aa29.47■■■□□ 2.31
NISCH-201ENST00000345716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.43■■■□□ 2.3
NISCH-201ENST00000345716 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
NISCH-201ENST00000345716 MYT1Q01538 1121 aa29.3■■■□□ 2.28
NISCH-201ENST00000345716 ARID3CA6NKF2 412 aa29.28■■■□□ 2.28
NISCH-201ENST00000345716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
NISCH-201ENST00000345716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
NISCH-201ENST00000345716 ANP32CO43423 234 aa29.19■■■□□ 2.26
NISCH-201ENST00000345716 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
NISCH-201ENST00000345716 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.15■■■□□ 2.26
NISCH-201ENST00000345716 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.13■■■□□ 2.25
NISCH-201ENST00000345716 NACADO15069 1562 aa29.07■■■□□ 2.24
NISCH-201ENST00000345716 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
NISCH-201ENST00000345716 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
NISCH-201ENST00000345716 BCANQ96GW7 911 aa28.97■■■□□ 2.23
NISCH-201ENST00000345716 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NISCH-201ENST00000345716 CLIP1P30622 1438 aa28.87■■■□□ 2.21
NISCH-201ENST00000345716 EEA1Q15075 1411 aa28.81■■■□□ 2.2
NISCH-201ENST00000345716 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.78■■■□□ 2.2
NISCH-201ENST00000345716 TONSLQ96HA7 1378 aa28.78■■■□□ 2.2
NISCH-201ENST00000345716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA3Q08378 1498 aa28.74■■■□□ 2.19
NISCH-201ENST00000345716 CEP162Q5TB80 1403 aa28.74■■■□□ 2.19
NISCH-201ENST00000345716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
NISCH-201ENST00000345716 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.7■■■□□ 2.19
NISCH-201ENST00000345716 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.67■■■□□ 2.18
NISCH-201ENST00000345716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
NISCH-201ENST00000345716 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.63■■■□□ 2.17
NISCH-201ENST00000345716 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
NISCH-201ENST00000345716 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.56■■■□□ 2.16
NISCH-201ENST00000345716 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NISCH-201ENST00000345716 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
NISCH-201ENST00000345716 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.48■■■□□ 2.15
NISCH-201ENST00000345716 KIF27Q86VH2 1401 aa28.48■■■□□ 2.15
NISCH-201ENST00000345716 TSPY4P0CV99 314 aa28.38■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 TSPY10P0CW01 314 aa28.38■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.35■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.132e-6■□□□□ 9.1
NISCH-201ENST00000345716 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 FKBP8Q14318 412 aa28.33■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
NISCH-201ENST00000345716 MIER1Q8N108 512 aa28.32■■■□□ 2.12
NISCH-201ENST00000345716 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.32■■■□□ 2.12
NISCH-201ENST00000345716 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.31■■■□□ 2.12
NISCH-201ENST00000345716 SOGA1O94964 1423 aa28.28■■■□□ 2.12
NISCH-201ENST00000345716 NEFMP07197 916 aa28.27■■■□□ 2.12
NISCH-201ENST00000345716 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
NISCH-201ENST00000345716 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.21■■■□□ 2.11
NISCH-201ENST00000345716 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.2■■■□□ 2.1
NISCH-201ENST00000345716 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
NISCH-201ENST00000345716 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.14■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.13■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 TMC1Q8TDI8 760 aa28.13■■■□□ 2.09
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