RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333868.9

CASP9-201, Transcript of caspase 9, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP9, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-201ENST00000333868 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.7■■■■■ 6.67
CASP9-201ENST00000333868 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.93■■■■■ 5.58
CASP9-201ENST00000333868 ABCC9O60706 1549 aa48.14■■■■■ 5.3
CASP9-201ENST00000333868 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
CASP9-201ENST00000333868 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.3■■■■■ 5.16
CASP9-201ENST00000333868 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.8■■■■■ 5.08
CASP9-201ENST00000333868 NACADO15069 1562 aa46.69■■■■■ 5.06
CASP9-201ENST00000333868 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.58■■■■■ 5.05
CASP9-201ENST00000333868 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.56■■■■■ 5.04
CASP9-201ENST00000333868 SCRIBQ14160 1630 aa45.85■■■■■ 4.93
CASP9-201ENST00000333868 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.71■■■■■ 4.91
CASP9-201ENST00000333868 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.71■■■■■ 4.91
CASP9-201ENST00000333868 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.83
CASP9-201ENST00000333868 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.17■■■■■ 4.82
CASP9-201ENST00000333868 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
CASP9-201ENST00000333868 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
CASP9-201ENST00000333868 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
CASP9-201ENST00000333868 SMARCA4P51532 1647 aa43.83■■■■■ 4.61
CASP9-201ENST00000333868 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.8■■■■■ 4.6
CASP9-201ENST00000333868 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
CASP9-201ENST00000333868 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.53■■■■■ 4.56
CASP9-201ENST00000333868 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
CASP9-201ENST00000333868 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
CASP9-201ENST00000333868 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.31■■■■■ 4.52
CASP9-201ENST00000333868 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.31■■■■■ 4.52
CASP9-201ENST00000333868 SMARCA2P51531 1590 aa43.27■■■■■ 4.52
CASP9-201ENST00000333868 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
CASP9-201ENST00000333868 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
CASP9-201ENST00000333868 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
CASP9-201ENST00000333868 HMGXB3Q12766 1538 aa42.95■■■■■ 4.47
CASP9-201ENST00000333868 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
CASP9-201ENST00000333868 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.45■■■■■ 4.39
CASP9-201ENST00000333868 NESP48681 1621 aa41.96■■■■■ 4.31
CASP9-201ENST00000333868 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.92■■■■■ 4.3
CASP9-201ENST00000333868 CFTRP13569 1480 aa41.85■■■■■ 4.29
CASP9-201ENST00000333868 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.82■■■■■ 4.28
CASP9-201ENST00000333868 PRDM2Q13029 1718 aa41.72■■■■■ 4.27
CASP9-201ENST00000333868 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.5■■■■■ 4.23
CASP9-201ENST00000333868 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.5■■■■■ 4.23
CASP9-201ENST00000333868 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.49■■■■■ 4.23
CASP9-201ENST00000333868 ERCC6Q03468 1493 aa41.37■■■■■ 4.21
CASP9-201ENST00000333868 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
CASP9-201ENST00000333868 ABCC8Q09428 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
CASP9-201ENST00000333868 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
CASP9-201ENST00000333868 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.04■■■■■ 4.16
CASP9-201ENST00000333868 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CASP9-201ENST00000333868 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.02■■■■■ 4.16
CASP9-201ENST00000333868 CUX1P39880 1505 aa41.02■■■■■ 4.16
CASP9-201ENST00000333868 SYNJ1O43426 1573 aa41.01■■■■■ 4.16
CASP9-201ENST00000333868 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CASP9-201ENST00000333868 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.94■■■■■ 4.15
CASP9-201ENST00000333868 TOPBP1Q92547 1522 aa40.94■■■■■ 4.14
CASP9-201ENST00000333868 TRIM41Q8WV44 630 aa40.9■■■■■ 4.14
CASP9-201ENST00000333868 TOP2BQ02880 1626 aa40.88■■■■■ 4.14
CASP9-201ENST00000333868 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.87■■■■■ 4.13
CASP9-201ENST00000333868 WDR62O43379 1518 aa40.86■■■■■ 4.13
CASP9-201ENST00000333868 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.73■■■■■ 4.11
CASP9-201ENST00000333868 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CASP9-201ENST00000333868 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.56■■■■■ 4.08
CASP9-201ENST00000333868 CUX2O14529 1486 aa40.52■■■■■ 4.08
CASP9-201ENST00000333868 SOGA1O94964 1423 aa40.52■■■■■ 4.08
CASP9-201ENST00000333868 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CASP9-201ENST00000333868 IFT140Q96RY7 1462 aa40.37■■■■■ 4.05
CASP9-201ENST00000333868 WDR97A6NE52 1622 aa40.33■■■■■ 4.05
CASP9-201ENST00000333868 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.3■■■■■ 4.04
CASP9-201ENST00000333868 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CASP9-201ENST00000333868 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
CASP9-201ENST00000333868 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.23■■■■■ 4.03
CASP9-201ENST00000333868 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CASP9-201ENST00000333868 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.023e-6■■■□□ 17.3
CASP9-201ENST00000333868 KIF27Q86VH2 1401 aa40.13■■■■■ 4.02
CASP9-201ENST00000333868 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CASP9-201ENST00000333868 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.09■■■■■ 4.01
CASP9-201ENST00000333868 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.06■■■■■ 4
CASP9-201ENST00000333868 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
CASP9-201ENST00000333868 EEA1Q15075 1411 aa39.92■■■■□ 3.98
CASP9-201ENST00000333868 GRIN2BQ13224 1484 aa39.87■■■■□ 3.97
CASP9-201ENST00000333868 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.87■■■■□ 3.97
CASP9-201ENST00000333868 IGF1RP08069 1367 aa39.86■■■■□ 3.97
CASP9-201ENST00000333868 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.82■■■■□ 3.96
CASP9-201ENST00000333868 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.77■■■■□ 3.96
CASP9-201ENST00000333868 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.77■■■■□ 3.96
CASP9-201ENST00000333868 CUL7Q14999 1698 aa39.69■■■■□ 3.94
CASP9-201ENST00000333868 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.67■■■■□ 3.94
CASP9-201ENST00000333868 ADAMTS12P58397 1594 aa39.65■■■■□ 3.94
CASP9-201ENST00000333868 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
CASP9-201ENST00000333868 FBLN2P98095 1184 aa39.59■■■■□ 3.93
CASP9-201ENST00000333868 PRXQ9BXM0 1461 aa39.58■■■■□ 3.93
CASP9-201ENST00000333868 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.58■■■■□ 3.93
CASP9-201ENST00000333868 KIF21BO75037 1637 aa39.53■■■■□ 3.92
CASP9-201ENST00000333868 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.52■■■■□ 3.92
CASP9-201ENST00000333868 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
CASP9-201ENST00000333868 SYNJ2O15056 1496 aa39.5■■■■□ 3.91
CASP9-201ENST00000333868 CHD1O14646 1710 aa39.49■■■■□ 3.91
CASP9-201ENST00000333868 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.48■■■■□ 3.91
CASP9-201ENST00000333868 GOLGA3Q08378 1498 aa39.4■■■■□ 3.9
CASP9-201ENST00000333868 GRIN2AQ12879 1464 aa39.4■■■■□ 3.9
CASP9-201ENST00000333868 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
CASP9-201ENST00000333868 CEP170Q5SW79 1584 aa39.21■■■■□ 3.87
CASP9-201ENST00000333868 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.18■■■■□ 3.86
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