RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.33■■■■■ 5.33
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GALNT12-201ENST00000375011 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41■■■■■ 4.15
GALNT12-201ENST00000375011 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
GALNT12-201ENST00000375011 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GALNT12-201ENST00000375011 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.55■■■■■ 4.08
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GALNT12-201ENST00000375011 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.22■■■■□ 3.87
GALNT12-201ENST00000375011 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
GALNT12-201ENST00000375011 SCRIBQ14160 1630 aa38.7■■■■□ 3.79
GALNT12-201ENST00000375011 ABCC9O60706 1549 aa38.47■■■■□ 3.75
GALNT12-201ENST00000375011 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.71
GALNT12-201ENST00000375011 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.24■■■■□ 3.71
GALNT12-201ENST00000375011 PCGF6Q9BYE7 350 aa38■■■■□ 3.67
GALNT12-201ENST00000375011 NACADO15069 1562 aa37.99■■■■□ 3.67
GALNT12-201ENST00000375011 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.9■■■■□ 3.66
GALNT12-201ENST00000375011 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.87■■■■□ 3.65
GALNT12-201ENST00000375011 HRCP23327 699 aa37.71■■■■□ 3.63
GALNT12-201ENST00000375011 TRIM41Q8WV44 630 aa37.68■■■■□ 3.62
GALNT12-201ENST00000375011 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.67■■■■□ 3.62
GALNT12-201ENST00000375011 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
GALNT12-201ENST00000375011 WIZO95785 1651 aa37.49■■■■□ 3.59
GALNT12-201ENST00000375011 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.44■■■■□ 3.58
GALNT12-201ENST00000375011 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
GALNT12-201ENST00000375011 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
GALNT12-201ENST00000375011 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
GALNT12-201ENST00000375011 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.02■■■■□ 3.52
GALNT12-201ENST00000375011 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
GALNT12-201ENST00000375011 SMARCA4P51532 1647 aa36.84■■■■□ 3.49
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GALNT12-201ENST00000375011 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.7■■■■□ 3.47
GALNT12-201ENST00000375011 ABCC8Q09428 1581 aa36.67■■■■□ 3.46
GALNT12-201ENST00000375011 SMARCA2P51531 1590 aa36.6■■■■□ 3.45
GALNT12-201ENST00000375011 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.52■■■■□ 3.44
GALNT12-201ENST00000375011 SOGA1O94964 1423 aa36.28■■■■□ 3.4
GALNT12-201ENST00000375011 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.15■■■■□ 3.38
GALNT12-201ENST00000375011 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
GALNT12-201ENST00000375011 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
GALNT12-201ENST00000375011 PEG3Q9GZU2 1588 aa36■■■■□ 3.35
GALNT12-201ENST00000375011 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.99■■■■□ 3.35
GALNT12-201ENST00000375011 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
GALNT12-201ENST00000375011 CEP162Q5TB80 1403 aa35.96■■■■□ 3.35
GALNT12-201ENST00000375011 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.96■■■■□ 3.35
GALNT12-201ENST00000375011 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
GALNT12-201ENST00000375011 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
GALNT12-201ENST00000375011 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
GALNT12-201ENST00000375011 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.82■■■■□ 3.33
GALNT12-201ENST00000375011 SYNJ1O43426 1573 aa35.8■■■■□ 3.32
GALNT12-201ENST00000375011 EEA1Q15075 1411 aa35.77■■■■□ 3.32
GALNT12-201ENST00000375011 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
GALNT12-201ENST00000375011 GOLGA3Q08378 1498 aa35.66■■■■□ 3.3
GALNT12-201ENST00000375011 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
GALNT12-201ENST00000375011 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.45■■■■□ 3.27
GALNT12-201ENST00000375011 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.36■■■■□ 3.25
GALNT12-201ENST00000375011 KIF21BO75037 1637 aa35.35■■■■□ 3.25
GALNT12-201ENST00000375011 CLIP1P30622 1438 aa35.32■■■■□ 3.24
GALNT12-201ENST00000375011 TOP2BQ02880 1626 aa35.26■■■■□ 3.24
GALNT12-201ENST00000375011 NCAPD3P42695 1498 aa35.2■■■■□ 3.23
GALNT12-201ENST00000375011 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
GALNT12-201ENST00000375011 HMGXB3Q12766 1538 aa35.13■■■■□ 3.21
GALNT12-201ENST00000375011 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.1■■■■□ 3.21
GALNT12-201ENST00000375011 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.09■■■■□ 3.21
GALNT12-201ENST00000375011 CUX1P39880 1505 aa35.05■■■■□ 3.2
GALNT12-201ENST00000375011 APLP2Q06481 763 aa35.04■■■■□ 3.2
GALNT12-201ENST00000375011 CFTRP13569 1480 aa34.92■■■■□ 3.18
GALNT12-201ENST00000375011 PRXQ9BXM0 1461 aa34.9■■■■□ 3.18
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GALNT12-201ENST00000375011 KIF27Q86VH2 1401 aa34.81■■■■□ 3.16
GALNT12-201ENST00000375011 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.79■■■■□ 3.16
GALNT12-201ENST00000375011 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
GALNT12-201ENST00000375011 ARAP1Q96P48 1450 aa34.75■■■■□ 3.15
GALNT12-201ENST00000375011 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GALNT12-201ENST00000375011 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
GALNT12-201ENST00000375011 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.6■■■■□ 3.13
GALNT12-201ENST00000375011 CUX2O14529 1486 aa34.59■■■■□ 3.13
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
GALNT12-201ENST00000375011 PRDM2Q13029 1718 aa34.55■■■■□ 3.12
GALNT12-201ENST00000375011 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.52■■■■□ 3.12
GALNT12-201ENST00000375011 IGF1RP08069 1367 aa34.5■■■■□ 3.11
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.49■■■■□ 3.11
GALNT12-201ENST00000375011 NEUROD1Q13562 356 aa34.48■■■■□ 3.11
GALNT12-201ENST00000375011 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.46■■■■□ 3.11
GALNT12-201ENST00000375011 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
GALNT12-201ENST00000375011 ITGAEP38570 1179 aa34.36■■■■□ 3.09
GALNT12-201ENST00000375011 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.35■■■■□ 3.09
GALNT12-201ENST00000375011 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.3■■■■□ 3.08
GALNT12-201ENST00000375011 P3H3Q8IVL6 736 aa34.28■■■■□ 3.08
GALNT12-201ENST00000375011 NESP48681 1621 aa34.26■■■■□ 3.07
GALNT12-201ENST00000375011 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
GALNT12-201ENST00000375011 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.23■■■■□ 3.07
GALNT12-201ENST00000375011 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
GALNT12-201ENST00000375011 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
GALNT12-201ENST00000375011 MIER1Q8N108 512 aa34.18■■■■□ 3.06
GALNT12-201ENST00000375011 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.17■■■■□ 3.06
GALNT12-201ENST00000375011 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
GALNT12-201ENST00000375011 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
GALNT12-201ENST00000375011 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.1■■■■□ 3.05
GALNT12-201ENST00000375011 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
GALNT12-201ENST00000375011 TOPBP1Q92547 1522 aa34.05■■■■□ 3.04
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