Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPEF1Q9Y4P9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPEF1Q9Y4P9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPEF1Q9Y4P9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPEF1Q9Y4P9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPEF1Q9Y4P9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPEF1Q9Y4P9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPEF1Q9Y4P9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPEF1Q9Y4P9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPEF1Q9Y4P9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPEF1Q9Y4P9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPEF1Q9Y4P9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPEF1Q9Y4P9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPEF1Q9Y4P9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPEF1Q9Y4P9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPEF1Q9Y4P9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPEF1Q9Y4P9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPEF1Q9Y4P9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPEF1Q9Y4P9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPEF1Q9Y4P9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPEF1Q9Y4P9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPEF1Q9Y4P9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPEF1Q9Y4P9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPEF1Q9Y4P9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPEF1Q9Y4P9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPEF1Q9Y4P9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms