Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK33

ZNF580, Zinc finger protein 580, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF580Q9UK33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF580Q9UK33 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF580Q9UK33 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF580Q9UK33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF580Q9UK33 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF580Q9UK33 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF580Q9UK33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF580Q9UK33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF580Q9UK33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF580Q9UK33 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF580Q9UK33 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF580Q9UK33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF580Q9UK33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF580Q9UK33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF580Q9UK33 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF580Q9UK33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF580Q9UK33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF580Q9UK33 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF580Q9UK33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF580Q9UK33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF580Q9UK33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF580Q9UK33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF580Q9UK33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF580Q9UK33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF580Q9UK33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF580Q9UK33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF580Q9UK33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF580Q9UK33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF580Q9UK33 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF580Q9UK33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF580Q9UK33 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms